本片描述二十二世紀一名電腦代號為尼歐的電腦駭客，他總是覺得世界一切都不對勁，但卻又說不出所以然來。常常在夢中、或電腦中都會有個聲音對他說話，讓他分不清真實與夢境的界限。直到他來到地下自由鬥士的組織，才真相大白。於是他和一群身懷絕技的鬥士，開始展開對抗控制全體人類的『電腦魔王』的使命……